I quattro splendidi altari, posizionati due da un lato e due dall’altro in quattro piccole cappelle, furono realizzati in pietra e decorati con vetro dipinto, con una particolare lavorazione che lo fa sembrare marmo.
Per arricchire e completare le quattro cappelle, si ordinarono a Tommaso Polluce tre delle quattro splendide tele che decorano gli altari.
A destra, si trovano Santa Gertrude e l’Abate San Benedetto; a sinistra, invece, San Mauro Abate e la Trinità.