La cupola fu realizzata dopo il sisma del 1693.
La struttura è a calotta unica, ovvero ad un solo strato, un tempo rivestito da piastrelle quadrate in terracotta smaltate, e rimosse con gli ultimi restauri del 2008.
Essa è scandita da doppi costoloni convergenti nella lanterna che presenta un cupolino di coronamento completato da una sfera metallica.
La base della cupola, ovvero il tamburo, è cilindrica all’interno e ottagonale all’esterno, e contiene otto grandi finestroni e un camminamento, delimitato da un’elegante balaustra, che ne accompagna la struttura.