Sebbene Panarea sia la più piccola isola dell’arcipelago, in realtà se si considerasse l’intero edificio vulcanico ne risulterebbero dimensioni del tutto rispettabili, e paragonabili con la più grande Lipari.
La parte sottomarina di Panarea ha una profondità massima di 100 metri, e corrisponde allo spianamento da parte dell’attività dell’erosione marina nel momento in cui il mare si trovava ad un altro livello rispetto all’attuale, e quando già l’edificio principale di Panarea era collassato in diversi punti.